Нарушение микробиоты кишечника в остром периоде инфекционной диареи у детей и сравнительная оценка влияния последующей терапии нифуроксазидом и препаратами группы цефалоспоринов

Микробиом кишечника играет важную роль в поддержании гомеостаза человеческого организма. Изменение состава микробного сообщества ассоциировано со многими заболеваниями. В частности, при острых кишечных инфекциях микробиота может играть роль в патогенезе воспалительного процесса. Лекарственные препараты по-разному влияют на количественный и качественный состав микробного сообщества и могут таким образом опосредованно влиять на ход выздоровления.
Цель. Оценить состав микробиоты кишечника в остром периоде инфекционной диареи у детей и влияние на него последующей терапии нифуроксазидом и препаратами группы цефалоспоринов.
Пациенты и методы. В исследование был включен 21 больной острой кишечной инфекцией «инвазивного» типа ребенок, из которых 12 детей в дальнейшем получали терапию нифуроксазидом (группа ИН), а 9 – цефалоспоринами 3-го поколения (группа ИЦ). Группу контроля составили 10 здоровых детей (группа К). Длительность курса антибактериальной терапии составила 5–7 дней. Для всех участников исследования было проведено исследование микробного состава образцов кала с использованием высокопроизводительного секвенирования гена 16S рРНК. Анализ данных был проведен на платформе «Кномикс-Биота» и в среде программирования R.
Результаты. Уже в раннем периоде острой «инвазивной» кишечной инфекции у детей регистрируется снижение альфа-разнообразия – интегральной характеристики микробного сообщества, оценивающей количество видов в нем и равномерность их относительной представленности. Также наблюдается повышение суммарной доли бактерий-оппортунистов по сравнению со здоровыми детьми. Наиболее выраженно было повышение представителей семейства Fusobacteriacea. После лечения альфа-разнообразие восстановилось только в группе, принимавшей нифуроксазид. Различия в динамике представленности условно патогенной микрофлоры в интервенционных группах были обусловлены изначальным различием микробиома между группами, связанным с их небольшой численностью. В группе ИН доля семейства Fusobacteriaceae до начала лечения была выше, чем у здоровых детей, но сразу после лечения и через 1 мес после его окончания не отличалась от характерной для здоровых детей. Группа ИЦ до начала лечения отличалась от здоровых детей только большей долей бактерий-оппортунистов; к концу лечения этот показатель восстановился до значений, характерных для здоровых детей.
Заключение. Применение нифуроксазида в терапии острой кишечной инфекции «инвазивного» типа у детей сопровождается восстановлением важного интегрального показателя состава микробиоты – альфа-разнообразия, а также сокращением доли условно патогенных семейств (в частности, Fusobacteriaceae). В группе сравнения, принимавшей цефалоспорины, доля условных патогенов также снижалась, но восстановления альфа-разнообразия не наблюдалось.
Ключевые слова: острые кишечные инфекции, дети, антибактериальная терапия, нифуроксазид, цефалоспорины, микробиота кишечника, 16S рРНК секвенирование
Для цитирования: Усенко Д.В., Горелов А.В., Одинцова В.Е., Каштанова Д.А., Кошечкин С.И., Тяхт А.В., Крикун В.С. Нарушение микробиоты кишечника в остром периоде инфекционной диареи у детей и сравнительная оценка влияния последующей терапии нифуроксазидом и препаратами группы цефалоспоринов. Инфекционные болезни. 2020; 18(3): 88–96. DOI: 10.20953/1729-9225-2020-3-88-96

Статья находится в открытом доступе

Яндекс.Метрика