Оценка эффективности определения длительности ВИЧ-инфекции путем анализа генетической вариабельности вируса

Автор / Мед учреждения

Киреев Дмитрий Евгеньевич / Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Российская Федерация / Российский университет дружбы народов, Москва, Российская Федерация

Шлыкова (Мурзакова) Анастасия Вениаминовна / Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Российская Федерация

Лопатухин Алексей Эдуардович / Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Российская Федерация

Покровская Анастасия Вадимовна / Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Российская Федерация

Шемшура Андрей Борисович / Клинический центр борьбы со СПИД Минздрава Краснодарского края, Краснодар, Российская Федерация

В.В.Кулагин / Клинический центр борьбы со СПИД Минздрава Краснодарского края, Краснодар, Российская Федерация

Г.А.Шипулин / Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Российская Федерация

В.В.Покровский / Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Российская Федерация
Цель. Оценка чувствительности и специфичности методики подсчета вариабельных позиций, присутствующих в геноме ВИЧ, для определения длительности инфекции в популяции ВИЧ-инфицированных граждан России.

Пациенты и методы. Эффективность методики, основанной на определении гетерогенности ВИЧ, была оценена на 119 образцах плазмы крови от ВИЧ-инфицированных пациентов с известной датой заражения. При этом среднее значение продолжительности инфицирования составило 15 мес, а медианы – 8 мес. В исследуемой выборке образцы от пациентов, инфицированных менее года назад, составили 68% (81 из 119). В когорте было 55 женщин (46%) и 64 мужчины (54%). На момент забора крови для проведения исследования генома вируса по возрасту пациенты варьировали от 0 до 79 лет, средний возраст составил 31 год, медиана – 31 год. 

Результаты. Было рассчитано, что для 119 исследованных образцов линейная зависимость между длительностью инфекции и степенью вариабельности последовательности описывается формулой y = 0,0012*x + 0,0021 (R2 = 0,52). Такое уравнение позволило рассчитать порог вариабельности в 0,33%, который определял длительность ВИЧ-инфекции в 12 мес. На основании полученных данных были рассчитаны значения чувствительности и специфичности молекулярного метода выявления недавней инфекции, которые составили 79,01 и 63,16% соответственно (сравнимы с ранее опубликованными данными). Для каждого пациента была рассчитана длительность инфекции, которая затем сравнена с длительностью, основанной на эпидемиологических данных: для 42% образцов ошибка в определении
длительности инфекции составила менее 1 года, а для 92% образцов – менее 3 лет.

Заключение. Данная методика может быть с успехом использована на практике для оценки качества скрининговых программ по выявлению ВИЧ-инфекции, проводимых в различных регионах и для разных групп риска. Кроме того, она может быть применима для подтверждения наличия недавней (менее 1 года) инфекции.

Ключевые слова: ВИЧ-1, генетическая вариабельность, гетерогенность, давность заражения, длительность инфекции, заболеваемость, ранняя ВИЧ-инфекция.

Для цитирования: Киреев Д.Е., Мурзакова А.В., Лопатухин А.Э., Покровская А.В., Шемшура А.Б., Кулагин В.В., Шипулин Г.А., Покровский В.В. Оценка эффективности определения длительности ВИЧ-инфекции путем анализа генетической вариабельности вируса. Инфекционные болезни. 2017; 15(2): 54–59.
DOI: 10.20953/1729-9225-2017-2-54-59
Стоимость статьи: 100 ք
Получить доступ
Пароль:

Яндекс.Метрика